После возвращения в реальный мир Сэм постоянно думает о Системе и не хочет бросать дело всей жизни его отца. Он делает откат системы в 1989й год, 349й Цикл Трона, - то время, когда Клу начал войну против изоморфов.

Вместе с Кворрой он отправляется в Систему и обнаруживает, что восстановилось не только всё то великолепие, которым хотел похвастать Кевин, но и сам Кевин, и Клу, и города изоморфов - Арджия и Бострум... и кроме всего этого - и вирус Абраксас, о котором Сэм не успел узнать у Флинна во время их короткой встречи.

На этот раз Сэм имеет достаточно опыта и средств, чтобы отключить Клу и погрузить его в спящий режим. Одной проблемой меньше, однако этого недостаточно для восстановления полного порядка. Кроме того, несмотря на радость от того, что отец снова с ним, Сэм чувствует подвох: Флинн не желает выходить из Сети, выглядит, как двадцать лет назад, и Сэм не может с уверенностью сказать, с чем столкнулся - с копией, образом, глюком Системы или чем-то совсем новым.

Текущее положение группировок в Системе:

Сэм и Кворра появляются в Троне нерегулярно и ненадолго. Кевин, вернее, то неизвестное, чем он сейчас является, живёт в Убежище и не покидает его. Главнокомандующим остаётся Трон, он же управляет частью города, не захваченной армией Клу.
Программы, перепрограммированные Клу для подчинения ему, занимают немалую территорию города, кроме того, большое количество отдельных групп и отрядов действуют на Периферии и в Арджии. Их штаб-квартира находится в Игровой Сети, в которую по-прежнему отлавливаются программы без регистрации и изоморфы.

Вирус Абраксас тоже доставляет большие неудобства, оказывая внимание Арджии и периодически наведываясь в Трон. Его заражение распространяется медленно, но число заражённых растёт, и справиться с напастью становится всё сложнее. Жителям Бострума тоже стоит поостеречься: ходят слухи, что скоро Абраксас доберётся и до этой плохо укреплённой крепости.